埃博拉病毒是高度危險的病原體，必須在專門的實驗設施內進行病毒的分離與鑑定。在非洲疫區主要通過檢測埃博拉病毒的特異性IgM和IgG抗體以及檢查病毒抗原或核酸等進行診斷。
⑴病毒特異性抗體的檢查
病人血液中的病毒特異性IgM抗體在發病後2～9天出現，持續存在到發病後1～6個月；IgG抗體在發病後6～18天出現，持續存在到發病後2年以上。用基因工程方法製備出的病毒核心蛋白羧基端多肽為抗原，建立的檢測埃博拉病毒IgG抗體的ELISA方法，特異性和敏感性較高。但對於部分急性期血清中特異性抗體滴度很低的患者，應同時進行病毒抗原或核酸的檢測。
⑵病毒特異性抗原和核酸的檢查
已經證實檢測埃博拉病毒抗原與檢測病毒核酸的一致性幾乎達到100%，敏感度很高。並且，用?射線照射標本並滅活病毒後，再檢測病毒抗原或RNA時，實驗安全性增高，且實驗結果也不受顯著影響。
英國科學家研究顯示切勿吃含有蛋白質成分的食物,而在科特迪瓦流傳了一種方法,把牛尿煮沸飲用。
現今唯一對抗方法為註射NPC1阻礙劑, 埃博拉病毒需透過NPC1進入細胞核進行自身複製, NPC1蛋白於細胞間進行運輸膽固醇, 即使阻礙劑會阻擋膽固醇的運輸路線造成尼曼匹克症但那是可以容忍的。絕大多數的爆發都是短暫的時間。 NPC1阻礙劑也能對抗馬堡病毒。